Piispainkokouksen alaisuudessa toimii pysyväisluonteisia toimikuntia, jotka piispainkokous on asettanut seuraamaan ja edistämään piispainkokouksen vastuuseen kuuluvia toimialueita. Piispainkokous asettaa tarvittaessa myös määräaikaisia työryhmiä päätösten valmistelua varten.